A construção da igreja data de meados do século XV, mas antes de ser denominada Igreja do Divino Espírito Santo, teve outras duas denominaçãoes: até 1654, era chamada Igreja Calvinista dos Franceses; após 1654, Igreja de Nossa Senhora do Ó; e a partir de 1855, Igreja do Divino Espírito Santo. Foi tombada pelo Iphan em 1972.