O Arsenal foi construído a mando do Conde de Bobadela (o governador Gomes Freire de Andrade) que, preocupado com as investidas dos corsários na cidade, construiu um arsenal de guerra capaz de armar seus soldados que vinham de Portugal. Com a chegada da família Real e a indepêndencia, o Arsenal ganha grandes proporções para produção e armazenamento de armas e munições para abastecer a Guarda Nacional e depois o Exército Brasileiro. Em 1922 abriga parte da Exposição do Centenário da Independência do Brasil, quando o arsenal foi transferido para a Ponta do Caju. Ponta do Calabouço e o Arsenal de Guerra, local onde hoje se localiza o Museu Histórico Nacional

Ponta do Calabouço, pós aterro da praia de Santa Luzia.

A Fortaleza de Santiago hoje abriga o Museu Histórico Nacional.