Quando da viagem à cachoeira Paulo Afonso, em 1859, o Imperador D. Pedro II por lá pernoitou. O início do povoamento aconteceu por volta de 1611, abrigando brancos e índios que vinham da Serra do Aracaré, em Sergipe. Em 1660 as terras que dariam origem ao município (que já haviam pertencido aos índios e a Cristovão da Rocha) foram doadas como sesmaria ao português Lourenço José de Brito Correia. Lourenço instalou então uma fazenda de gado batizada de Pão de Açúcar, devido às fôrmas em que se colocava o açúcar produzido no Brasil para a exportação. Por volta de 1815 as terras foram arrematadas em leilão pela família do padre José Rodrigues Delgado, que deu impulso ao desenvolvimento do povoado. Em 1877 foi elevada à categoria de cidade.

A fotografia do povoado de Limoeiro, tirada em janeiro de 1869, integra o relatório de viagem do Presidente da Província de Alagoas, José Bento da Cunha Figueiredo Junior, quando de uma excursão à Cachoeira de Paulo Afonso. O relatório, escrito por Ollympio Euzébio de Arroxelas Galvão e José Antônio Magalhães Basto, trazia inúmeras imagens das povoações alagoans ribeirinhas do São Francisco, todas produzidas por Abílio Coutinho. Na época, segundo o relatório, o povoado era constituído por duas ruas, cerca de sessenta casas e uma capela dedicada a Jesus, Maria e José, cuja construção prolongou-se de 1782 até 1787.

Quando da viagem à cachoeira Paulo Afonso, em 1859, o Imperador D. Pedro II por lá pernoitou. Em 1877 foi elevada à categoria de cidade. O Rio São Francisco foi descoberto logo no começo da colonização, mas suas primeiras povoações datam do fim do século XVI e XVII.